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中产阶级如何利用量化投资工具完成财富进阶

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统计转移学习(及其在统计过程控制的应用)

宗福季
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Building Better Connected World with Artificial Intelligence Tec

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主题介绍

RNA-sequencing is a popular technology used by scientists to study changes in gene expression levels across tens of thousands of genes simultaneously. Representing gene expression levels, the counts in each sample are typically analysed by categorising samples into groups of interest, and obtaining gene-wise summary statistics in the form of log-fold changes, t-statistics, p-values, and the like. The data and its results can be explored by plotting one summary statistic against another and highlighting genes that are significant or of interest. The new Bioconductor package, Glimma, generates interactive graphics for plots typically found in the limma package with the enhanced feature of connecting many levels of information within the analysis on a single html page using d3.js. A Glimma-style mean-difference plot, or the more generic xy-plot, allows one to click on the points to bring up a new plot of sample-wise expression levels that is displayed alongside the original plot. This feature enables researchers to interrogate the data more intensely than ever before without the need to repeat the work for every gene under examination. The plots include options to search and select for genes of interest, and zoom in and out for better resolution. Unlike the traditional multi-dimensional scaling (MDS) plot, Glimma’s MDS plot shows several dimensions and group combinations on the same page. The functions within Glimma are tailored to integrate smoothly with objects native to limma, edgeR and DESeq2, and can be extended for use with microarray, single-cell and methylation data analyses.
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